রোববার (২৫ মে) শিক্ষা মন্ত্রণালয়ের মাধ্যমিক ও উচ্চশিক্ষা বিভাগ থেকে জারি করা প্রজ্ঞাপনে তাকে নিয়োগ দেওয়া হয়। রাষ্ট্রপতির আদেশক্রমে এতে সই করেন সহকারী সচিব মো. শাহ আলম সিরাজ। প্রজ্ঞাপনে বলা হয়েছে, বেসরকারি বিশ্ববিদ্যালয় আইন, ২০১০-এর ধারা ৩৫(৭) অনুযায়ী চট্টগ্রামের সাউদার্ন ইউনিভার্সিটি বাংলাদেশের শিক্ষা কার্যক্রম অব্যাহত রাখার স্বার্থে ব্রিগেডির জেনারেল মো. ফারুককে বিশ্ববিদ্যালয়টির প্রশাসক হিসেবে নিয়োগ দেওয়া হলো। চারটি শর্তে তাকে প্রশাসক পদে নিয়োগ দেওয়া হয়েছে। সেগুলো হলো- প্রশাসক হিসেবে তাকে সাময়িকভাবে নিয়োগ প্রদান করা হলো। তবে রাষ্ট্রপতি ও আচার্য যে কোনো সময় এ নিয়োগ আদেশ বাতিল করতে পারবেন। তিনি বিশ্ববিদ্যালয়ের বিধি মোতাবেক বেতন-ভাতা প্রাপ্য হবেন।

প্রশাসক হিসেবে মো. ফারুককে বিশ্ববিদ্যালয়ের পরিবেশ স্বাভাবিক ও উন্নত করার লক্ষ্যে একটি কর্মপরিকল্পনা প্রণয়ন করতে বলা হয়েছে এবং তা বিশ্ববিদ্যালয় মঞ্জুরি কমিশনের (ইউজিসি) সুপারিশের ভিত্তিতে শিক্ষা মন্ত্রণালয়ের অনুমোদনের পর এটি বাস্তবায়ন করতে হবে। জানা যায়, ২০২১ সালের ১৬ মার্চ অধ্যাপক মো. মোজাম্মেল হককে সাউদার্ন বিশ্ববিদ্যালয়ের উপাচার্য নিয়োগ দেওয়া হয়। ২০২৪ সালের ১ এপ্রিল তার মেয়াদকাল শেষ হওয়ার কথা ছিল। তবে মেয়াদ শেষ হওয়ার আগেই তাকে জোরপূর্বক বিশ্ববিদ্যালয় থেকে অপসারণ করা হয়। এরপর থেকে উপাচার্যের পদটি শূন্য। পরে বিশ্ববিদ্যালয়ের কোষাধ্যক্ষকে উপাচার্যের চলতি দায়িত্ব দেওয়া হয়।